Методические рекомендации 3.1.0272-22. 3.1 содержат в том числе: требования к сопроводительной информации о предоставляемом материале, к транспортированию материала; алгоритм дифференциации генетических вариантов вируса SARS-COV-2.

Приоритетные критерии для забора материала для секвенирования, в том числе: от лиц, прибывших из-за рубежа; от лиц, инфицированных (с признаками и без признаков заболевания) спустя 30 и более суток после вакцинации; от детей и подростков до 17 лет с клиническими признаками заболевания и др.

http://www.consultant.ru/law/hotdocs/73310.html
 
МР 3.1.0272-22. 3.1. Профилактика инфекционных болезней. Молекулярно-генетический мониторинг штаммов возбудителя новой коронавирусной инфекции. Методические рекомендации (утв. Главным государственным санитарным врачом РФ 10.01.2022) (вместе с "Требованиями к файлам, содержащим информацию о нуклеотидной последовательности", "Инструкцией по работе с программой genome.crie.ru")