.png)
Тяжелая малярийная анемия (СМА) является ведущей причиной заболеваемости и смертности детей, связанных с малярией. Генетические факторы, влияющие на развитие СМА и неэффективного эритропоэза, центрального патогенетического признака СМА, изучены лишь частично.
МЕТОДЫ. В представляемой работе проведено пилотное геном-широкое ассоциативное исследование (GWAS) на детях с Plasmodium falciparum. GWAS было выполнено с помощью Illumina® Infinium® HD Super Assay в сочетании с Illumina's® Human Omni2.5-8v1 Bead Chip (с > 2.45 М маркеры). Данные были проанализированы с помощью однократного SNP логистического регрессионного анализа с аддитивной моделью управления наследованием для ковариатов. Результаты пилотного глобального геномного исследования показали, что вариация интерлейкина (IL-7) ассоциирована с повышенным риском развития СМА. Чтобы подтвердить этот вывод, исследована связь между генотипами и/или гаплотипами двух однонуклеотидных полиморфизмов (SNPs) в IL7 [72194 T/C и - 2440 A/G] и восприимчивостью как к SMA, так и к неэффективному эритропоэзу, т.е. индекс продукции ретикулоцитов (RPI) < 2,0 у детей с анемией (Hb< 11,0 г / дл). Дети с малярией P. falciparum(< 3 лет, n = 883) были стратифицированы на две группы: неосложненная малярия (UM, n = 718) и SMA (n = 165).
РЕЗУЛЬТАТЫ. Регрессионное моделирование, контролирующее анемические конфаундеры, показало, что носительство генотипа ТС в положении 72194 Т с ассоциировано с повышенной восприимчивостью к неэффективному эритропоэзу (OR = 1,90; 95% CI 1,09-3,30; P = 0,02), как и гомозиготный CC (OR 5,14; 95% CI = 1,20-21,99; P = 0,03). В соответствии с этим выводом, лица с гаплотипом CA (72194C/ - 2440A) имели повышенный риск неэффективного эритропоэза (OR = 1,90; 95% CI = 1,10-3,30; P = 0,02), тогда как носители гаплотипа TA имели маргинальную защиту от неэффективного эритропоэза (OR = 0,24; 95% CI = 0,06-1,21; Р = 0,05). Эти наблюдения были подтверждены трендовым тестом Кокрана-Армитажа для неэффективного эритропоэза (CA>TA>CG; P< 0,01). Хотя ни один из генотипов и/или гаплотипических вариантов не был достоверно связан с СМА, направление профилей риска соответствовало результатам эритропоэза.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ. Вместе взятые, вариации IL-7 связаны с эритропоэтическими реакциями у детей с малярией falciparum, с центральной физиологической особенностью, способствующей развитию SMA.
МЕТОДЫ. В представляемой работе проведено пилотное геном-широкое ассоциативное исследование (GWAS) на детях с Plasmodium falciparum. GWAS было выполнено с помощью Illumina® Infinium® HD Super Assay в сочетании с Illumina's® Human Omni2.5-8v1 Bead Chip (с > 2.45 М маркеры). Данные были проанализированы с помощью однократного SNP логистического регрессионного анализа с аддитивной моделью управления наследованием для ковариатов. Результаты пилотного глобального геномного исследования показали, что вариация интерлейкина (IL-7) ассоциирована с повышенным риском развития СМА. Чтобы подтвердить этот вывод, исследована связь между генотипами и/или гаплотипами двух однонуклеотидных полиморфизмов (SNPs) в IL7 [72194 T/C и - 2440 A/G] и восприимчивостью как к SMA, так и к неэффективному эритропоэзу, т.е. индекс продукции ретикулоцитов (RPI) < 2,0 у детей с анемией (Hb< 11,0 г / дл). Дети с малярией P. falciparum(< 3 лет, n = 883) были стратифицированы на две группы: неосложненная малярия (UM, n = 718) и SMA (n = 165).
РЕЗУЛЬТАТЫ. Регрессионное моделирование, контролирующее анемические конфаундеры, показало, что носительство генотипа ТС в положении 72194 Т с ассоциировано с повышенной восприимчивостью к неэффективному эритропоэзу (OR = 1,90; 95% CI 1,09-3,30; P = 0,02), как и гомозиготный CC (OR 5,14; 95% CI = 1,20-21,99; P = 0,03). В соответствии с этим выводом, лица с гаплотипом CA (72194C/ - 2440A) имели повышенный риск неэффективного эритропоэза (OR = 1,90; 95% CI = 1,10-3,30; P = 0,02), тогда как носители гаплотипа TA имели маргинальную защиту от неэффективного эритропоэза (OR = 0,24; 95% CI = 0,06-1,21; Р = 0,05). Эти наблюдения были подтверждены трендовым тестом Кокрана-Армитажа для неэффективного эритропоэза (CA>TA>CG; P< 0,01). Хотя ни один из генотипов и/или гаплотипических вариантов не был достоверно связан с СМА, направление профилей риска соответствовало результатам эритропоэза.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ. Вместе взятые, вариации IL-7 связаны с эритропоэтическими реакциями у детей с малярией falciparum, с центральной физиологической особенностью, способствующей развитию SMA.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31420016
Kisia LE2, Kempaiah P, Anyona SB, Munde EO, Achieng AO, Ong'echa JM, Lambert CG, Chelimo K, Ouma C, Perkins DJ, Raballah E. Genetic variation in interleukin-7 is associated with a reduced erythropoietic response in Kenyan children infected with Plasmodium falciparum. BMC Med Genet. 2019 Aug 16;20(1):140. doi: 10.1186/s12881-019-0866-z.
.png)
Комментарии (0)
Зарегистрируйтесь, чтобы добавить комментарий