Современные способы изучения бактерий включают большое количество молекулярно-генетических методов: полимеразная цепная реакция, гибридизация со специфичными последовательностями ДНК, анализ кривых плавления высокого разрешения, определение нуклеотидных последовательностей бактериальных генов и геномов. Наиболее информативные способы анализа бактериальных генов основываются на высокопроизводительном параллельном секвенировании. Главной отличительной особенностью этих методов является возможность получения информации о структуре всех генов, входящих в состав бактериальных хромосом и плазмид. Другая их важная особенность в том, что они дают возможность изучения некультивируемых бактерий, а также бактерий, для которых невозможно получение чистой культуры. 

В работе приведено описание биоинформационных методов исследований, использованных для анализа геномов Chlamydia psittaci. Данный микроорганизм является облигатным внутриклеточным паразитом, культивирование которого возможно только с использованием живых эукариотических клеток. Особенность препаратов ДНК, получаемых из подобных образцов, заключается в значительном содержании нуклеиновых кислот из эукариотических клеток. В работе изучена эффективность методов биоинформационного анализа для осуществления сборки геномных последовательностей Chlamydia psittaci.

Источник: http://www.obolensk.org/files/journal/2018/Bacteriology2018-v3-n3.pdf 
Богун А.Г., Федорова В.А., Кисличкина А.А., Сизова А.А., Дятлов И.А. Изучение геномной организации Chlamydia psittaci с применением алгоритмов метагеномных исследований. Бактериология. 2018; 3(3): 7–13. DOI: 10.20953/2500-1027-2018-3-7-13
Bogun A.G., Fedorova V.A., Kislichkina A.A., Sizova A.A., Dyatlov I.A. The study of the genomic organization of Chlamydia psittaci by using algorithms for metagenomic research. Bacteriology. 2018; 3(3): 7-13. (In Russian). DOI: 10.20953/2500-1027-2018-3-7-13