Вести науки

Колоректальный рак оказывает значительное влияние как на людей, так и на системы здравоохранения в целом. Было выявлено множество генов, оказывающих влияние на его патогенез.  Однако, генетическая основа гистологии слизистой опухоли, агрессивного подтипа колоректального рака, в настоящее время не известна.

Методы. Данные геномного однонуклеотидного полиморфизма (SNP) исследовали в когорте больных колоректальным раком (n = 505).  Анализ ассоциации был проведен для 729 373 общих SNP и 275 645 редких SNP. Общий анализ ассоциаций SNP проводился с использованием одномерной и многомерной логистической регрессии при различных генетических моделях. Анализ ассоциаций редких вариантов проводился с использованием мультимаркерного теста.

Результаты. Ни одна ассоциация не достигла традиционного общегеномного значения. Однако, были выявлены перспективные генетические ассоциации. В частности, площадь под ROC-кривой увеличилась с 0,703 (95% Ди: 0,634–0,773) до 0,916 (95% Ди: 0,873–0,960) при рассмотрении наиболее значимых SNPs. Кроме того, анализ редких вариантов выявил ряд генетических областей, которые потенциально содержат случайные  варианты, связанные с фенотипом слизистой опухоли.

Выводы. Это первое исследование с применением как общих, так и редких вариантов анализа для идентификации генетических ассоциаций с фенотипом слизистой опухоли с использованием общегеномных данных. Данные результаты свидетельствуют о новых ассоцияциях со слизистыми опухолями. После подтверждения эти результаты не только помогут понять биологическую основу слизистой гистологии, но и помогут разработать таргентные варианты лечения слизистых опухолей.