Некоторые кишечные бактерии действуют как фактор, способствующий развитию колоректального рака (CRC). Кроме того, учитывая, что микробиом кишечника может быть обнаружен в различных образцах (стул, ткань, кровь и т. д.), он классифицируется на фекальный микробиом, микробиом крови и микробиом тканей.

С целью предоставить обзор недавнего прогресса исследований, в этом обзоре обобщены характеристики кишечного микробиома в разных образцах на каждом этапе CRC и их эффективность скрининга.

Скрининговые модели, построенные из различных образцов микробиомов (здоровая/колоректальная аденома, здоровая/CRC и колоректальная аденома/CRC), имеют как сильные, так и ограниченные стороны с точки зрения воспроизводимости биомаркеров и площади в соответствии с характеристической кривой (AUC) скрининговых моделей. Многие бактерии, такие как Bifidobacteria, Fusobacterium nucleatum (F. n), Geotrichum candidum, Porphyromonas asaccharolytica, Escherichia coli, Rhodococcus, Anaerostipes caccae, Enhydrobacter, Lachnoclostridiumsp. m3, Bacteroides clarus, Clostridium hathewayi, Ruminococcaceae, Bacteroides thetaiotaomicron, Culinariside и энтеротоксигенные Bacteroides fragilis (ETBF) показывают благоприятную диагностическую эффективность при раннем скрининге колоректального рака.

В предлагаемом вниманию полнотекстовом обзоре подчеркивается, что стул, кровь, ткани и кишечная жидкость являются основными источниками образцов биомаркеров, каждый из которых имеет свои преимущества и ограничения. Кроме того, другие образцы, такие как внеклеточные везикулы и биопленки, также заслуживают дальнейшего внимания.
 

Gut microbiome: New biomarkers in early screening of colorectal cancer - Zhou - 2022 - Journal of Clinical Laboratory Analysis - Wiley Online Library 
Zhou P, Yang D, Sun D, Zhou Y. Gut microbiome: New biomarkers in early screening of colorectal cancer. J Clin Lab Anal. 2022 May;36(5):e24359. doi: 10.1002/jcla.24359. Epub 2022 Mar 21. PMID: 35312122; PMCID: PMC9102648.