Специфичность взаимодействий между олигонуклеотидными зондами, иммобилизованными в биологическом микрочипе (биочипе), и таргетной ДНК зависит от ряда факторов, при этом основные роли играют длина зонда и нуклеотидная последовательность (главным образом GC-состав).

Известно, что 2'-O-метилолигорибонуклеотиды образуют более стабильные дуплексы с комплементарной ДНК по сравнению с 2'-дезоксирибонуклеотидными зондами. В ходе исследования проверялась возможность использования 2'-O-метилолигорибонуклеотидов для повышения специфичности взаимодействий между ДНК-мишенью и зондами, иммобилизованными в биочипе.

Меченую флуорофором ДНК-мишень получали с помощью односторонней асимметричной ПЦР с одновременным включением флуоресцентной метки в продукт ПЦР. После гибридизации с иммобилизованными зондами флуоресцентные сигналы от гелевых подложек с 2'-O-метилолигорибонуклеотидными зондами были в среднем в два раза выше, чем от сигналов с 2'-дезоксирибонуклеотидными зондами при одинаковых последовательностях ДНК-мишени и концентрациях зонда. Увеличение интенсивности флуоресценции было больше в случае совпадающих дуплексов по сравнению с несовпадающими.
 

2'-O-Methyl Oligoribonucleotide Analogs Used to Change the Temperature Characteristics of Immobilized Probes and to Enhance the Specificity of Hybridization | SpringerLink 
Ikonnikova A.Y., Surzhikov S.A., Pozhitnova V.O. et al. 2'-O-Methyl Oligoribonucleotide Analogs Used to Change the Temperature Characteristics of Immobilized Probes and to Enhance the Specificity of Hybridization. BIOPHYSICS 63, 876–879 (2018). https://doi.org/10.1134/S0006350918060118