Пилотное исследование.

Цель: Оценить точность и надежность комплексного хромосомного скрининга с помощью секвенирования следующего поколения (NGS) биоптатов трофэктодермы человека (TE).

Методы: Были проверены надежность и точность диагнозов, поставленных преимплантационным генетическим тестированием на анеуплоидию (PGT-A) на основе биопсии TE. Повторные биопсии TE и образцов внутренней клеточной массы (ICM) были получены из размороженных бластоцист, ранее протестированных NGS. Чтобы проверить надежность анализа NGS, образцы биопсии сравнивали с исходными результатами PGT-A. Предыдущее тестирование NGS классифицировало образцы TE как эуплоидные, анеуплоидные или анеуплоидно-мозаичные. Полученные образцы повторной биопсии подверглись полногеномной амплификации SurePlex с последующей NGS через платформу MiSeq, со значением числа копий (CNV), определенным с помощью программного обеспечения BlueFuse Multi. Первичным критерием оценки была надежность, определяемая как соответствие между исходным результатом TE и повторными биопсиями. Точность определялась соответствием между образцами TE и ICM,

Результаты: Повторная биопсия была выполнена на 32 эмбрионах с предшествующей PGT-A, показывающей эуплоидию (10 эмбрионов), анеуплоидию одной или двух хромосом (4 эмбриона) или анеуплоидно-мозаичную форму с одной анеуплоидной хромосомой и одной мозаичной хромосомой (18 эмбрионов). Сто двадцать девять образцов биопсии завершили NGS (90 TE и 39 ICM биопсий), и 105 результатов биопсии были включены в анализ. Биопсия TE обеспечивает высокоточный тест будущего плода с уровнем дисомной конкордантности ICM 97,6%. Показатели клинической согласованности показывают, что биопсия TE обеспечивает надежный тест, когда результат эуплоидный (99,5%) или анеуплоидный (97,3%), но менее надежный, когда результат мозаичный (35,2%).

Заключение: Биопсия TE позволяет прогнозировать эуплоидию или анеуплоидию в ICM с высокой степенью точности. Показано, что PGT-A с NGS биопсий TE является очень надежным, с клинически значимой степенью согласованности для анеуплоидии и эуплоидии более 95%. Биопсии TE, указывающие на мозаицизм, были менее надежными (35,2%), предположительно из-за того, что события митотического нерасхождения не равномерно распределены по бластоцисте. Однако классификация TE-биопсии PGT-A с результатами NGS как анеуплоидная или эуплоидная обеспечивает высоконадежный тест.  
 

https://link.springer.com/article/10.1007/s10815-020-01720-x 
Sachdev, N.M., McCulloh, D.H., Kramer, Y. et al. The reproducibility of trophectoderm biopsies in euploid, aneuploid, and mosaic embryos using independently verified next-generation sequencing (NGS): a pilot study. J Assist Reprod Genet 37, 559–571 (2020). https://doi.org/10.1007/s10815-020-01720-x