Актуальность исследования. Альтернативный сплайсинг (AС) является важной стадией созревания мРНК, которая позволяет увеличить вариабельность и разнообразие белков у эукариот. АС не регулируется при многих заболеваниях и его влияние на канцерогенный процесс хорошо известно. Однако прогресс в понимании того, как онкогенные вирусы модулируют сплайсинг и как эта модуляция участвует в вирусной онкогенности был ограничен. Вирус Эпштейна-Барр (EBV) вовлечен в различные виды рака и его онкопротеин EBNA1 является единственным вирусным белком, экспрессируемым во всех злокачественных новообразованиях, обусловленных EBV.

Методы. В данном исследовании способность EBNA1 модулировать АС клеточных генов была оценена с использованием высокопроизводительного подхода ПЦР в реальном времени для изучения АС у 1238, связанных с раком генов. Иммунопреципитация РНК в сочетании с анализом РНК-секвенирования (RIP-Seq) также выполнялась для идентификации клеточных мРНК, связанных с EBNA1.

Результаты. После экспрессии EBNA1 были обнаружены модификации в профилях АС 89 генов, участвующих в канцерогенезе. Кроме того, было показано, что EBNA1 модулирует уровни экспрессии различных факторов сплайсинга, таких как hnRNPA1, FOX-2 и SF1. Наконец, иммунопреципитация РНК в сочетании с анализами РНК-секвенирования демонстрирует, что EBNA1 иммунопреципитирует специфические клеточные мРНК, но не те, которые различно сплайсируются в клетках, экспрессирующих EBNA1.

Заключение. Белок EBNA1 может модулировать профили АС многочисленных клеточных генов. Интересно, что этот модулирующий белок не требует РНК-связывающей активности EBNA1. В целом, результаты данного исследования подчеркивают новую роль EBNA1 в качестве модулятора клеточного сплайсинга.

https://virologyj.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12985-019-1137-5
The Epstein-Barr virus EBNA1 protein modulates the alternative splicing of cellular genes
S. Boudreault, V. Armero, M.S. Scott, J-P Perreault, M Bisaillon
Virology Journal (2019) 16:29 https://doi.org/10.1186/s12985-019-1137-5