В данном исследование показано, связаны ли полиморфизмы в промоторе кластера miR-17-92 с чувствительностью к IS в китайской популяции. Кроме того, связь между этими полиморфизмами и экспрессией кластера miR-17-92 также была дополнительно проанализирована.
Кластер microRNA-17-92 (miR-17-92) является одним из наиболее изученных кластеров miRNA. Было обнаружено, что аномальная экспрессия кластера играет важную роль при различных видах заболеваний человека, включая ишемический инсульт (IS). Целью исследования было изучение связи между тремя полиморфизмами (rs1491034, rs9301654 и rs982873) в промоторе кластера miR-17-92 и риском IS.
Триста девяносто восемь пациентов с IS и 397 контрольных субъектов были включены в исследование. Генотипы трех полиморфизмов были определены с помощью анализа генотипирования Snapshot SNP. Относительная экспрессия кластера в мононуклеарных клетках периферической крови (РВМС) пациентов и контролей была исследована с помощью количественной ПЦР в реальном времени.
Значительная связь между полиморфизмом rs9301654 и риском IS наблюдалась на основании анализа генотипа, модели и аллеля (GA против AA: скорректированный OR = 0,63, 95% CI: 0,41 ~ 0,97, P = 0,037; GG против AA: скорректированный OR = 0,23, 95% ДИ: 0,07 ~ 0,78, P = 0,018; GA + GG против AA: скорректированный OR = 0,57, 95% CI: 0,38 ~ 0,87, P = 0,009; GA + AA против GG: скорректированный OR = 0,27, 95% ДИ: 0,08 ~ 0,89, Р = 0,032; G относительно А: скорректированный ИЛИ = 0,58, 95% ДИ: 0,40 ~ 0,83). Анализ гаплотипов показал, что гаплотипы TGC и TGT были связаны со сниженным риском IS (OR = 0,59, 95% CI: 0,40 ~ 0,87, P = 0,007 для гаплотипа TGC; OR = 0,21, 95% CI: 0,06 ~ 0,75, P = 0,009 для гаплотипа ТГТ). Важно, что мы обнаружили, что экспрессия miR-17-5p была значительно выше, в то время как miR-19a-3p была значительно ниже у пациентов с IS по сравнению с контрольной группой ( P <0,01), а у пациентов с генотипом rs9301654GG или GA наблюдался более низкий уровень miR-19a-3p по сравнению с генотипом AA ( P <0,01).
Результаты показали, что полиморфизм rs9301654 в промоторе кластера miR-17-92 может быть связан с восприимчивостью IS в китайской популяции. Тем не менее, было обнаруженно, что полиморфизм rs9301654 и соответствующая ему экспрессия генов не демонстрируют последовательной ассоциации с IS в китайской популяции. Необходимы дальнейшие исследования, такие как взаимодействие генов с генами, чтобы выявить роль miR-19a и его регуляторных генов в этиологии IS.
В этом исследовании впервые сообщается, что полиморфизм rs9301654 в промоторе кластера miR-17-92 может быть связан с восприимчивостью IS, что может служить некоторым доказательством этиологии IS и может являться потенциальным биомаркером и терапевтическим средством для болезни. Обнаруженно, что полиморфизм rs9301654 и соответствующая ему экспрессия генов не демонстрируют последовательной ассоциации с IS в китайской популяции. Таким образом, необходимы дальнейшие исследования, чтобы выявить роль miR-19a и его регуляторных генов в этиологии IS.
Кластер microRNA-17-92 (miR-17-92) является одним из наиболее изученных кластеров miRNA. Было обнаружено, что аномальная экспрессия кластера играет важную роль при различных видах заболеваний человека, включая ишемический инсульт (IS). Целью исследования было изучение связи между тремя полиморфизмами (rs1491034, rs9301654 и rs982873) в промоторе кластера miR-17-92 и риском IS.
Триста девяносто восемь пациентов с IS и 397 контрольных субъектов были включены в исследование. Генотипы трех полиморфизмов были определены с помощью анализа генотипирования Snapshot SNP. Относительная экспрессия кластера в мононуклеарных клетках периферической крови (РВМС) пациентов и контролей была исследована с помощью количественной ПЦР в реальном времени.
Значительная связь между полиморфизмом rs9301654 и риском IS наблюдалась на основании анализа генотипа, модели и аллеля (GA против AA: скорректированный OR = 0,63, 95% CI: 0,41 ~ 0,97, P = 0,037; GG против AA: скорректированный OR = 0,23, 95% ДИ: 0,07 ~ 0,78, P = 0,018; GA + GG против AA: скорректированный OR = 0,57, 95% CI: 0,38 ~ 0,87, P = 0,009; GA + AA против GG: скорректированный OR = 0,27, 95% ДИ: 0,08 ~ 0,89, Р = 0,032; G относительно А: скорректированный ИЛИ = 0,58, 95% ДИ: 0,40 ~ 0,83). Анализ гаплотипов показал, что гаплотипы TGC и TGT были связаны со сниженным риском IS (OR = 0,59, 95% CI: 0,40 ~ 0,87, P = 0,007 для гаплотипа TGC; OR = 0,21, 95% CI: 0,06 ~ 0,75, P = 0,009 для гаплотипа ТГТ). Важно, что мы обнаружили, что экспрессия miR-17-5p была значительно выше, в то время как miR-19a-3p была значительно ниже у пациентов с IS по сравнению с контрольной группой ( P <0,01), а у пациентов с генотипом rs9301654GG или GA наблюдался более низкий уровень miR-19a-3p по сравнению с генотипом AA ( P <0,01).
Результаты показали, что полиморфизм rs9301654 в промоторе кластера miR-17-92 может быть связан с восприимчивостью IS в китайской популяции. Тем не менее, было обнаруженно, что полиморфизм rs9301654 и соответствующая ему экспрессия генов не демонстрируют последовательной ассоциации с IS в китайской популяции. Необходимы дальнейшие исследования, такие как взаимодействие генов с генами, чтобы выявить роль miR-19a и его регуляторных генов в этиологии IS.
В этом исследовании впервые сообщается, что полиморфизм rs9301654 в промоторе кластера miR-17-92 может быть связан с восприимчивостью IS, что может служить некоторым доказательством этиологии IS и может являться потенциальным биомаркером и терапевтическим средством для болезни. Обнаруженно, что полиморфизм rs9301654 и соответствующая ему экспрессия генов не демонстрируют последовательной ассоциации с IS в китайской популяции. Таким образом, необходимы дальнейшие исследования, чтобы выявить роль miR-19a и его регуляторных генов в этиологии IS.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6839137/
A functional polymorphism in the promoter of miR-17-92 cluster is associated with decreased risk of ischemic stroke
H. Huang, G. Wei, C. Wang, Y. Lu, C.Liu, R.Wang, X. Shi, J.Yang, Y. Wei. BMC Med Genomics. 2019; 12: 159.
Published online 2019 Nov 8. doi: 10.1186/s12920-019-0589-1
Комментарии (0)
Зарегистрируйтесь, чтобы добавить комментарий