Анализ репликации ВИЧ-1 может быть выполнен in vivo, но вне клетки связанные процессы обратной транскрипции и согласованной интеграции воспроизведены пока не были. В предлагаемом вниманию исследовании были воссозданы эти процессы в бесклеточной системе, используя очищенные вирионы ВИЧ-1 в качестве источника вирусных геномов и ферментов.

В течение первой половины жизненного цикла вирус ВИЧ-1 выполняет обратную транскрипцию своего РНК-генома и интегрирует копию двухцепочечной ДНК в хромосому клетки-хозяина. 

Несмотря на прогресс в описании и подавлении этих процессов, механические и структурные исследования in situ остаются сложной задачей. Это связано с тем, что указанные операции выполняются отдельными вирусными прединтеграционными комплексами глубоко внутри клеток. Поэтому исследователи представляемой публикации воссоздали и визуализировали ранние стадии репликации ВИЧ-1 в бесклеточной системе. 

Ядра ВИЧ-1, высвобождаемые из проницаемых вирионов, поддерживали эффективную капсид-зависимую эндогенную обратную транскрипцию с образованием геномов двухцепочечной ДНК, которые иногда петлей выходили из разорванных стенок капсида. Согласованная интеграция обоих концов вирусной ДНК в плазмиду-мишень затем протекала в зависимой от клеточного экстракта реакции.
 

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33033190/
Christensen DE, Ganser-Pornillos BK, Johnson JS, Pornillos O, Sundquist WI. Reconstitution and visualization of HIV-1 capsid-dependent replication and integration in vitro. Science. 2020 Oct 9;370(6513):eabc8420. doi: 10.1126/science.abc8420. PMID: 33033190.