МЕТОДЫ: В этом исследовании использованы данные из базы данных Atlas Genome Atlas (TCGA-ESCA) для анализа экспрессии и выживаемости для MAGE A3 / 4/11 (подтип MAGE-A) с использованием онлайн-инструмента UALCAN. Кроме того, были использованы данные высокопроизводительного секвенирования пациентов с плоскоклеточным раком пищевода (ESCC) из базы данных TCGA для анализа ассоциации, онтологии генов (GO), и Киотской энциклопедии базы генов и геномов (KEGG) для обогащения базы расчётов MAGE A3 / 4/9/11 с использованием LinkeDomics (онлайн-инструмент) и ClueGO (внутреннее программное обеспечение Cytoscape). Наконец, относительные генные экспрессии MAGE A3 / 4/9/11 были подтверждены с помощью количественной ПЦР в реальном времени (q-PCR) у пациентов с ЭК.
РЕЗУЛЬТАТЫ: MAGE A3 / 4/11 были высокоэкспрессированы в тканях пациентов с ESCC, и не было разницы во времени выживания для пациентов между высокоэкспрессированными и низкими / среднеэкспрессированными. Анализ обогащения Go показал, что 4 подтипа MAGE-A (MAGE-A3 / 4/9/11) были обогащены в регуляции адаптивного иммунного ответа, инициации трансляции, продукции интерлейкина-4, ответа на интерферон типа I и кожи развитие соответственно. Результаты KEGG показали, что они обогащены сигнальным путем рецептора Т-клеток (MAGE-A3), дифференцировкой Th1 и Th2, процессингом и презентацией антигена (MAGE-A4), взаимодействием цитокин-цитокинового рецептора (MAGE-A9) и сигнальным путем хемокинов (MAGE-А11).
ЗАКЛЮЧЕНИЕ: MAGE A3 / 4/9/11 высокоэкспрессированы в ЕС и включены в регуляцию иммунного ответа. Они могут рассматриваться в качестве кандидатов иммунной мишени при лечении ЭК.
https://insights.ovid.com/crossref?an=00005792-201905240-00043
Sieber F, Neufeld KJ, Gottschalk A, Bigelow GE, Oh ES, Rosenberg PB, Mears SC, Stewart KJ, Ouanes JP, Jaberi M, Hasenboehler EA, Wang NY. Analysis of the function of MAGE-A in esophageal carcinoma by bioinformatics. Br J Anaesth. 2019 Apr;122(4):480-489. doi: 10.1016/j.bja.2018.12.021. Epub 2019 Feb 4. PMID: 30857604
Комментарии (0)
Зарегистрируйтесь, чтобы добавить комментарий